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如何看質(zhì)粒圖譜?這4大要素缺一不可!
發(fā)布時(shí)間:2021-07-07瀏覽次數(shù):1091返回列表
在生物科研這個(gè)領(lǐng)域里,很多小伙伴都會(huì)接觸到質(zhì)粒這個(gè)小東西,而當(dāng)你費(fèi)盡千辛萬(wàn)苦后找到這個(gè)小東西的圖譜時(shí),你就會(huì)發(fā)現(xiàn)圖譜上有很多亂七八糟的箭頭,還有很多英文的序列,比如像什么ORI啊,Amp啊等等,那這些東西究竟是什么意思呢,今天小編就在這里為大家詳細(xì)解答一番。
首先要為大家介紹下質(zhì)粒圖譜包含的四大要素
1.復(fù)制起點(diǎn):控制著質(zhì)粒的復(fù)制,并決定了質(zhì)粒的宿主和拷貝數(shù)
2.篩選標(biāo)記:多為抗性基因,以便加以檢測(cè)篩選
3.多克隆位點(diǎn):外源基因的插入位點(diǎn)
4.其他元件:如轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件、翻譯表達(dá)元件和蛋白標(biāo)簽等
以下就用大家常用的pcDNA3.1(+)表達(dá)載體作為案例
步:了解質(zhì)粒圖譜中的復(fù)制起點(diǎn)
如上圖譜中的ori表示質(zhì)粒的復(fù)制起點(diǎn)。質(zhì)粒的復(fù)制起點(diǎn)決定了質(zhì)粒的宿主及質(zhì)粒的拷貝數(shù)相關(guān)。若圖譜上只有一個(gè)ori,表示質(zhì)粒是原核克隆及表達(dá)質(zhì)粒。而圖譜上有兩個(gè)ori,則表示該質(zhì)粒是穿梭質(zhì)粒,既可以在原核也可以在真核中復(fù)制。
第二步:了解質(zhì)粒圖譜中的篩選標(biāo)記
圖譜中的AmpR、KanR等表示質(zhì)粒載體中的篩選標(biāo)簽,多為抗生素抗性基因,方便后續(xù)通過(guò)抗生素篩選陽(yáng)性克隆。只存在單抗性的質(zhì)粒多為原核克隆載體和原核表達(dá)載體。而存在兩種或以上的抗性的多為穿梭質(zhì)粒。
第三步:了解質(zhì)粒圖譜中的多克隆位點(diǎn)
圖譜中的MCS區(qū)或者許多內(nèi)切酶集中的部分,就是質(zhì)粒的多克隆位點(diǎn)。多克隆位點(diǎn)為一系列限制性內(nèi)切酶酶切位點(diǎn),是外源DNA的插入位點(diǎn),一般可通過(guò)酶切后連接的方式將外源DNA插入質(zhì)粒。多克隆位點(diǎn)一般位于轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)和轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)之間。
第四步:了解質(zhì)粒圖譜中其它元件
質(zhì)粒載體中除復(fù)制起始位點(diǎn)、篩選標(biāo)記、多克隆位點(diǎn)外,還具有其他一些表達(dá)或調(diào)控元件,如轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件、翻譯調(diào)控元件和融合表達(dá)標(biāo)簽蛋白等。比如:
蛋白純化標(biāo)簽蛋白:His-Tag,GST-tag等
蛋白檢測(cè)標(biāo)簽蛋白:Myc-Tag,F(xiàn)lag-Tag,HA-Taq等
熒光蛋白表達(dá)標(biāo)簽:GFP,mCherry等